MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 chromosome

Total Repeats: 42920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017765	GC	3	6	54	59	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017765	TGC	2	6	123	128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017765	GTCC	2	8	144	151	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017765	AG	3	6	308	313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017765	TCGT	2	8	323	330	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017765	GCA	2	6	366	371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017765	C	6	6	398	403	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_017765	AGG	2	6	427	432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017765	GGA	2	6	478	483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017765	CGG	2	6	510	515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017765	TGG	2	6	534	539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017765	GGA	2	6	589	594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017765	GGCT	2	8	597	604	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017765	CGG	2	6	611	616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017765	GGC	2	6	647	652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017765	ACG	2	6	681	686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017765	AGG	2	6	726	731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017765	GACC	2	8	798	805	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017765	GGT	2	6	825	830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017765	CG	3	6	846	851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017765	GAG	2	6	859	864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017765	CAG	2	6	4416	4421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017765	CGGG	2	8	4422	4429	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017765	GCG	2	6	4463	4468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017765	CAT	2	6	4500	4505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017765	TGGCTG	2	12	5005	5016	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017765	CGT	2	6	5043	5048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017765	TCG	3	9	5094	5102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017765	GTC	2	6	5975	5980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017765	CCA	2	6	6015	6020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017765	CGCC	2	8	6025	6032	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_017765	GCC	2	6	6050	6055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017765	CGGC	2	8	6057	6064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017765	GAC	2	6	6070	6075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017765	GTGGG	2	10	6159	6168	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017765	CAT	2	6	6199	6204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017765	TCT	2	6	6451	6456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017765	AGG	2	6	6459	6464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017765	AGC	2	6	6473	6478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017765	CCG	2	6	6482	6487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017765	GCT	2	6	6503	6508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017765	TCC	2	6	6821	6826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017765	AGGGC	2	10	6827	6836	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017765	GC	3	6	6873	6878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017765	CCA	3	9	6879	6887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017765	GGC	2	6	6889	6894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017765	CGTT	2	8	6911	6918	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017765	GTC	2	6	6921	6926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017765	GCG	2	6	6937	6942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017765	GC	3	6	6965	6970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017765	TCC	2	6	7019	7024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017765	CAG	2	6	7063	7068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017765	CAG	2	6	7082	7087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017765	TCC	2	6	7094	7099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017765	TGA	2	6	7197	7202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017765	GATCAG	2	12	7216	7227	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017765	CTG	2	6	7253	7258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017765	GCG	2	6	7276	7281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017765	AGC	2	6	7313	7318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017765	CAG	3	9	7408	7416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017765	CGGCC	2	10	7438	7447	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
62	NC_017765	CCA	2	6	7462	7467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017765	GCC	2	6	7498	7503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017765	GGC	2	6	7523	7528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017765	CAG	2	6	7531	7536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017765	AGC	2	6	7555	7560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017765	GACCAA	2	12	7660	7671	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017765	CGA	2	6	7759	7764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017765	CGG	2	6	7775	7780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017765	GTG	2	6	7810	7815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017765	GCC	2	6	7857	7862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017765	C	6	6	7867	7872	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73	NC_017765	CGG	2	6	7927	7932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017765	TGG	2	6	7953	7958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017765	CGTC	2	8	7996	8003	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017765	CG	3	6	8008	8013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017765	GGCA	2	8	8090	8097	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017765	GC	3	6	8202	8207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017765	CTG	2	6	8257	8262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017765	GGTG	2	8	8330	8337	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017765	GAA	2	6	8340	8345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017765	CGT	2	6	8356	8361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017765	CCG	2	6	8362	8367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017765	TCG	2	6	8433	8438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017765	CGAG	2	8	8745	8752	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017765	GACG	2	8	9849	9856	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017765	GCG	2	6	9860	9865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017765	AGG	2	6	9870	9875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017765	CGC	2	6	10183	10188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017765	CGA	2	6	10189	10194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017765	ATG	2	6	10197	10202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017765	G	8	8	10210	10217	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017765	CAG	2	6	10321	10326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017765	GCC	2	6	10504	10509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017765	CAT	2	6	10519	10524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017765	CG	3	6	10525	10530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017765	GTG	2	6	10580	10585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017765	CGC	2	6	11853	11858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017765	GCCCG	2	10	11876	11885	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
100	NC_017765	CGG	2	6	11905	11910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017765	CGT	2	6	11925	11930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017765	GCGG	2	8	11947	11954	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017765	CCGC	2	8	11993	12000	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_017765	CAG	2	6	12021	12026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017765	GGC	2	6	12087	12092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017765	TCG	2	6	12100	12105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017765	GCCA	2	8	12118	12125	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017765	CTG	2	6	12182	12187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017765	CTT	2	6	12192	12197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017765	AGC	2	6	12214	12219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017765	CGC	2	6	12220	12225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017765	GCAG	2	8	12259	12266	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017765	CCG	2	6	12268	12273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017765	TCC	2	6	12295	12300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017765	CGT	2	6	12328	12333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017765	TCCC	2	8	12363	12370	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_017765	GCG	3	9	12397	12405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017765	GCC	2	6	12421	12426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_017765	CAG	2	6	12454	12459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017765	AGC	2	6	12465	12470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017765	CGTGC	2	10	12512	12521	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017765	GC	3	6	12520	12525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017765	CCT	2	6	12628	12633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_017765	CGCT	2	8	12681	12688	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017765	GCCC	2	8	12689	12696	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_017765	GGCAC	2	10	12757	12766	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017765	ACC	2	6	12789	12794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_017765	GCA	2	6	12868	12873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017765	CCGC	2	8	12889	12896	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_017765	GCCA	2	8	12902	12909	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017765	GACG	2	8	12912	12919	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017765	CACCGG	2	12	12920	12931	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017765	CCCGG	2	10	12997	13006	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
134	NC_017765	AC	5	10	13015	13024	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017765	CCGC	2	8	13066	13073	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_017765	CGA	3	9	13076	13084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017765	CCG	2	6	13102	13107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017765	GC	3	6	13126	13131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017765	CGC	2	6	13201	13206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_017765	C	6	6	13206	13211	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
141	NC_017765	CGGCC	2	10	13214	13223	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
142	NC_017765	TGCC	2	8	13241	13248	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017765	TGC	2	6	13254	13259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017765	TCCCGC	2	12	13263	13274	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_017765	CAC	2	6	13277	13282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_017765	CG	3	6	13283	13288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017765	GCC	2	6	13304	13309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_017765	CAC	2	6	13325	13330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_017765	ACG	2	6	13339	13344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017765	CCT	2	6	13369	13374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_017765	GCC	2	6	13392	13397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_017765	CCCG	2	8	13403	13410	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
153	NC_017765	CGCA	2	8	13547	13554	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_017765	CGT	2	6	13562	13567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_017765	CCG	2	6	13633	13638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_017765	CCCCA	2	10	13664	13673	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
158	NC_017765	ACC	2	6	13703	13708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_017765	GCC	2	6	13711	13716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_017765	GCC	2	6	13719	13724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_017765	CCG	2	6	13798	13803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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163	NC_017765	ACACC	2	10	13900	13909	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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171	NC_017765	GGC	2	6	16273	16278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_017765	TCCA	2	8	16310	16317	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
173	NC_017765	TCA	2	6	16326	16331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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176	NC_017765	CGG	2	6	16409	16414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_017765	CCGG	2	8	17767	17774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
182	NC_017765	CGG	2	6	17815	17820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_017765	CGT	2	6	17890	17895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_017765	CCG	2	6	18068	18073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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187	NC_017765	CAG	2	6	18290	18295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_017765	CG	4	8	27123	27130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
286	NC_017765	CGGG	2	8	27156	27163	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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288	NC_017765	CGG	2	6	27218	27223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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431	NC_017765	TCG	2	6	38783	38788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_017765	CGGG	2	8	38810	38817	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
433	NC_017765	CGAT	2	8	38833	38840	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
434	NC_017765	CCG	2	6	38849	38854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
435	NC_017765	TGA	2	6	39763	39768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_017765	TGG	2	6	39856	39861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_017765	GC	4	8	39912	39919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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449	NC_017765	CGG	2	6	40238	40243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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463	NC_017765	GAG	2	6	40749	40754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_017765	TCG	2	6	42158	42163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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478	NC_017765	CGCGG	2	10	46881	46890	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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481	NC_017765	GCG	2	6	46991	46996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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487	NC_017765	CCG	2	6	47310	47315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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494	NC_017765	CCGG	2	8	48665	48672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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